TÜBİTAK ARDEB 1001

Başlık: Antikanser etkili, peptidomimetik yapıda, HoxA9-Pbx1/3 protein-protein etkileşim inhibitörlerinin geliştirilmesi (121S519)

Proje Süresi: 10/2021-10/2024

Araştırmacı: Burak V. Kabasakal

Özet: Hox ve Pbx, birlikte çalışan, embriyo gelişiminde önemli roller oynayan, ancak deregülasyonları neticesinde tümör oluşumunda, yayılmasında ve hücre ölümüne dirençte rol oynayan iki sınıf transkripsiyon faktörüdür. Bu sebeple, Hox ve Pbx proteinlerinin birbiri ile etkileşimini inhibe edecek moleküller, Hox-Pbx fonksiyonunun kanserdeki patolojisinin aydınlatılmasında ve yeni tedavi yöntemlerinin geliştirilmesinde önemli roller oynayacaklardır. Projemizde, HoxA9-Pbx1 kristal yapısından hareketle, HoxA9’dan türetilen ve Pbx1’e ve homoloğu Pbx3’e (Pbx1/3) bağlanacak, hücre içerisine girebilecek (permeabıl), stabil, potent, peptit benzeri (peptidomimetik) HoxA9-Pbx1/3 protein-protein etkileşim inhibitörleri geliştirmeyi hedefliyoruz. Öncelikli olarak, inhibitörlerin Pbx1’e bağlanmalarını tespit etmek üzere iki farklı biyokimyasal yöntem geliştireceğiz. Ardından, HoxA9’un Pbx1’e bağlanmada kullandığı peptitin sekansını kısaltarak, bağlanma için yeterli en kısa (minimum) zinciri tespit edeceğiz. Bu minimum zincirinden hareketle yapı-etki araştırmalarını gerçekleştirirken, pararlel olarak, in silico çalışmalardan destek alacağız.

Projeyi Destekleyen Kurum: Uluslararası Atom Enerjisi Ajansı

Proje Başlığı: Doğal Kaynakların Etkin Kullanımı ve Çevresel Gözetim çalışmalarında Radyo-İzleyici ve Kapalı Kaynak Tekniklerinin Uyarlanması

Proje Süresi: 2022-2025 (4 yıl)

Proje Yürütücüsü: Süleyman Fatih ÖZMEN

Konu ve Önemi: Proje ile üye ülkelerin petrol ve jeotermal alanlarda, maden işleme tesislerinde, atık su arıtma havuzlarında, çimento imalatında, kimya ve petrol endüstrisinde, kıyı mühendisliği yönetimi ve baraj bakımında radyo-izleyici ve kapalı kaynak yöntemlerini uygulama olasılıklarını keşfetmeleri için mevcut metodolojileri ve stratejileri uyumlu hale getirmeyi ve güçlendirmeyi destekleyecektir. Bu aynı zamanda karbon emisyonlarının ve kirliliğin azaltılmasına, enerji ve kaynak verimliliğinin artırılmasına ve AB tarafından benimsenen yeşil ekonomi ve döngüsel ekonomi ile uyumlu olan biyoçeşitlilik ve ekosistem hizmetlerinin kaybının önlenmesine de katkıda bulunac